三亚蜈支洲岛度假中心拥有海南唯一的海岛旅游度假酒店。现有的91间各式风情客房，分为欧式建筑、竹木建筑和木制建筑，错落有致地分布在小岛的各处；根据房型、房间的地理位置和服务，这些客房又分为山景房、海景套房、观海木楼、临海木屋、豪华别墅、总统套房。客房周边环境十分幽美，房间内装修典雅，设备齐全，配有分体空调、冰箱、电脑（宽带上网）、保险柜、电视、电话、饮水机等设备。  
■　豪华山景房：    
　　仿欧式建筑（由原部队营房改建而成），座落于蜈支洲岛最高峰下。最近的山景房只需2分钟步行即到海边。山景房内部装修达四星标准，配有分体空调、电脑（宽带上网）、保险柜、电视、电话、饮水机等齐全设备。房间面积约28平方米，均为一室一卫结构。根据床型，该类客房又分为双标房、大床房二种房型。

■　海景套房：     
　　竹木独立建筑，座落于蜈支洲岛北面的海边，距离海边仅88米，洁白的沙滩、蔚蓝的大海、蓝蓝的天空、美丽的景色只在眼前，是观海、听涛的最佳之处。套房内部装修达四星标准，配有分体空调、冰箱、保险柜、电视、电话、饮水机等齐全设备。房间面积约45平方米，均为一室一厅一卫结构。根据床型，该类客房又分为双标房、大床房、家庭房三种房型。
■　观海木楼：    
　　木制楼房建筑，座落于蜈支洲岛中间的山坡上，距海边大约300米左右。是观海、聆听鸟类鸣声的最佳之处。从房间俯瞰蔚蓝的大海、佼洁的沙滩、茂盛的热带雨林等美丽的景色尽收眼底。套房内部装修达五星标准，配有分体空调、冰箱、保险柜、电视、电话、饮水机等齐全设备。房间面积约45平方米，均为一室一厅一卫结构，根据床型，该类客房又分为双标房、大床房、二种房型。
■　临海木屋：    
　　木制建筑，座落于蜈支洲岛最高峰下，直面大海，距离海边仅58米，躺在床上即可观海。是观海、听涛、聆听鸟类鸣声的绝佳之处。从房间俯瞰蔚蓝的大海、佼洁的沙滩等美丽的景色尽收眼底。套房内部装修达五星标准，配有分体空调、冰箱、电脑（宽带上网）、保险柜、电视、电话、饮水机等齐全设备。房间面积约66平方米，房间均为一室一厅一卫结构，均为大床房。 

■　豪华别墅：    
　　木制建筑，座落于蜈支洲岛最高峰下，直面大海，距离海边仅18米，是观海、听涛、聆听鸟鸣的绝佳之处。从房间观看外面的景色，蔚蓝的大海、佼洁的沙滩等美丽的景色尽收眼底。别墅内部装修达五星标准，房间内配有分体空调、冰箱、电脑（宽带上网）、保险柜、电视、电话、饮水机等齐全设备。每栋别墅设有客房两套，房间面积约130平方米，均为二室一厅二卫结构，大床房，每套客房的家具配置都不相同。 

■　总统别墅：    
　　木制建筑，座落于蜈支洲岛最高峰下，直面大海，距离海边仅18米，是观海、听涛、聆听鸟鸣的绝佳之处。从房间观看外面的景色，蔚蓝的大海、佼洁的沙滩等美丽的景色尽收眼底。别墅内部装修达五星标准，房间内配有分体空调、冰箱、电脑（宽带上网）、保险柜、电视、电话、饮水机等齐全设备。房间面积约为320平方米，四室二厅五卫一厨一餐厅结构，每间客房的家具配置都不相同，拥有私人淡水泳池、私人海滨浴场、沙滩。房间分为主卧、副卧。主卧为大床房（2间）、副卧为双标房（2间）。